Etapy vývoje metod odhadu plemenné hodnoty

Významné osobnosti z vývoje metod OPH:  Fisher; Lush a Hazel; Robertson; Henderson.

1. Selekční indexy pro OPH jedince

• lineární funkce, více informací do 1 čísla (index)
• vypočítaná hodnota – selekční kriterium
• první SI pro hospodářská zvířata – Hazel (1943), rozvinul Henderson (1963) – MNČ

Kroky:

1. Očištění podkladů od systematických vlivů prostředí („chovatel“) – problém nevybalancovanosti údajů, nebere v úvahu genetické rozdíly mezi zvířaty.
2. Výpočet SI z očištěných údajů pomocí genetických parametrů, u více vlastností stanovit ekonomické váhy (nejlepší lineární předpověď BLP je jen za předpokladů, které nebyly splnitelné:
   • nejsou systematické prostřeďové efekty nebo jsou eliminovány,
   • nejsou fixní genetické rozdíly mezi skupinami selektovaných jedinců (patří do populace se stejnou střední hodnotou),
   • známe variance a kovariance PH a nezjistitelných prostřeďových efektů.

2. OPH plemeníků na základě užitkovosti potomků

• zavedení umělé inseminace – tisíce jedinců
• původně dvě metody
• Robertson a Rendel (1954)
  • Porovnání užitkovosti dcer jednoho plemeníka s užitkovostí vrstevnic (contemporary comparsion).
  • Ve stejném roce, věku, období, na 1. laktaci.
• Henderson et al. (1954)
  • Porovnání užitkovosti dcer jednoho plemeníka s užitkovostí všech stádových vrstevnic po jiných plemenících (průměrnou užitkovostí stáda) (herdmate).
  • ve stejném roce a období.

Nezohledňovalo se:

• Není interakce mezi plemeníkem a stádem.
• Nezohledňovalo se, zda vrstevnice jsou po prověřených býcích či testantů; různé linie, rodiny, typy kříženců, věkové skupiny.

3. BLUP pro OPH

Zavedení lineárních modelů s pevnými a náhodnými efekty. Nejedná se o nejlepší odhadnuté hodnoty myslitelné, ale o nejlepší ze všech lineárních a nevychýlených hodnot.

• Nevybalancované data
• Lze odhadnout variance i kovariance
• Výkonné počítače a programy
• Systematické efekty rozdělit na náhodné a pevné
• Henderson (1963, 1973)
• Využívána od 70. let (u nás od konce 80.)
• U skotu
  • otcovský model (sire model)
  • mateřský model (dam model)

 BLUP je předpověď a vztahuje se k jedinci nebo ke skupině (náhodné efekty)

4. BLUP – AM (Henderson 1988)

Jedná se o individuální model – animal model (Quaas a Pollak, 1988)

• Komplexnější využití pro OPH všech jedinců v populaci současně, ale i jejich budoucích potomků
• Je více AM, aplikovatelné na různé situace a struktury dat, na více vlastností
• Rozpracováno pro všechny druhy HZ
• Standardní metoda OPH ve vyspělých státech

• hodnotí se každé zvíře samostatně a současně v závislosti na příbuznosti s ostatními jedinci hodnocené populace
• každé zvíře má svou rovnici
• spojení rovnic pomocí úplné aditivně genetické matice příbuznosti (velmi náročné na PC – využití až v poslední době)
• modelově lze řešit systém rovnic BLUP AM pomocí inverze matic
• pro rutinní výpočty se řeší iterativními postupy
• jednoznačné zvýšení přesnosti OPH

|

Aktualizováno: 07.10.2008