Úvod | Genetika populací | Fenotypová diverzita a VG | Měření VG | Organizace VG v populaci | Nenáhodné páření |
Dynamika populací | Mutace | Migrace | Selekce | Genetický drift |
Úvod | Základy statistiky | Regrese a korelace | Úvod QG | Kvantitativní vlastnosti | Koncept QG | Působení genů |
Úvod | Gen. parametry | Matice | Lineární modely | Odhady gen. parametrů |
Úvod | QG ve šlechtění | Pricnipy šlechtění | Postupy ve šlechtění | Plemenná hodnota | Teorie selekce | Odhad plemenné hodnoty |
Úvod | QG x MG | Genetické markery | MAS | Markery a BLUP | Mapování QTL | Souhrn
Souhrn | Závěrečný test |

Genetické základy šlechtění - Vlastnosti OPH

small logo

Plemenná hodnota - vlastnosti OPH

Genetické založení je neodhadnutelné (např. dojnice má schopnost dojit 5 – 10 – 15 tis. litrů mléka), ale odhadnutelné jsou rozdíly v genetickém založení pomocí PH.

OPH = odhad rozdílů genetického založení (nejde o absolutní užitkovost)

  • jedná se o odchylku od průměru vrstevníků!

Plemenná hodnota zvířete je relativní hodnota „genetické sestavy“ jedince v populaci a je součtem efektů všech jeho genů (které byly předány jeho otcem a matkou).

Př. Býk měl výrazně lepší užitkovost (350 kg hmotnosti v 1 roce) než populační průměr (300 kg). Jeho fenotyp jako odchylka je +50 kg. Je však tato fenotypová odchylka způsobena jen genetickými rozdíly? Ze základů genetiky kvantitativních znaků víme, že se zvířata od sebe liší jak z důvodu genetického založení tak prostřeďových odchylek. Býk by mohl být dobrý podle svých genů, ale také z důvodu, že se vyvíjel v lepších podmínkách. Otázka zní, jaká část fenotypových odchylek je způsobena genetickými, tzn. plemennou hodnotou?

Heritabilita (dědivost) je důležitý parametr. Heritabilita nám říká, jaká část ze všech pozorovaných fenotypových rozdílů je způsobena aditivně genetickými efekty = plemenné hodnoty. Má-li heritabilita hodnotu 0,40, lze odhadnout, že konkrétní jedinec má plemennou hodnotu 0,40 z +50 = +20. Plemenná hodnota je tedy odhadem:

odhadovaná plemenná hodnota = OPH = heritabilita x fenotypová odchylka

Větší část fenotypových rozdílů je připisována plemenné hodnotě, je-li heritabilita vyšší. Plemenná hodnota je odhadována regresí. Směrnice regresní přímky je heritabilita, která nám říká, jak velký rozdíl plemenné hodnoty lze očekávat za jednotku rozdílu fenotypu. Na obrázku níže je situace, když používáme pouze informaci o vlastní užitkovosti zvířete. Váha informace je rovna hodnotě heritability. Použijeme-li více informací zvýšíme přesnost OPH, tj. informace o korelovaných vlastnostech nebo o příbuzných jedincích, a lze vypočítat více vah mnohonásobným regresním modelem.

 

 

Využívá se kontrola užitkovosti a výkonná výpočetní technika. Přesto se jedná pořád o odhad. OPH lze zjednodušeně vyjádřit:

OPH = b . D

kde

  • b – regrese pro přepočet odchylky užitkovosti na PH (abychom se dostali na úroveň genetického založení) – pomocí něj je rozdíl užitkovosti přepočítaný na genetickou hodnotu
  • D – odchylka (diference) užitkovosti od průměru vrstevníků (referenční populace):   D = yi - mí
    • yi – fenotypová hodnota jedince i
    • mí - průměr referenční populace

vrstevnice – jedince ve stejném chlévě, na stejné laktaci, stejně staré, otelené a krmené (pro vyloučení všech vlivů, které ovlivňují PH) – jedinci chovaní za stejných podmínek

 

- obě hodnoty jsou spolu spojeny lineární regresí (b) skutečné plemenné hodnoty (a) na fenotypovou hodnotu (y) při OPH na základě vlastní užitkovost:

- kovariance mezi plemennou hodnotou a a prostřeďovou odchylkou e = 0, zůstává variance PH rovno aditivně genetické varianci var-a.

Regresní koeficient: , kde

  • r2spolehlivost odhadu PH (reliability » R – v katalozích) – determinační koeficient; umocněná korelace,
  • a – aditivní příbuznost ke zdroji informací (jestliže odhaduji PH jedince na základě vlastní užitkovosti pak a = 1; odhaduji-li PH u býka na základě jeho dcer – kontrola dědičnosti potomstva – pak a = 0,5; u polosourozenců  pak a = 0,25; …),
  • rpřesnost (odmocnina spolehlivosti), korelace mezi genotypem (skutečnou PH) a fenotypem; přesnost je větší než spolehlivost.

Přesnost OPH (r) je korelace mezi hodnotou fenotypovou (y) a plemennou (a), která může být složená z regrese plemenné hodnoty na fenotypovou vynásobenou podílem variance fenotypové a plemenné hodnoty přesnost OPH lze definovat také jako korelaci mezi skutečnou a odhadovanou PH:

Přesnost popisuje, kolik rozdílů mezi skutečnými plemennými hodnotami jsme schopni vysvětlit na základě odhadovaných plemenných hodnot.

Přesnost OPH lze definovat také jako korelaci mezi skutečnou a odhadovanou PH.

Při odhadu PH na základě fenotypu platí: , , kde

  • a – skutečná plemenná hodnota
  • â – odhadovaná plemenná hodnota

Přesnost OPH je tedy definována také jako korelace mezi skutečnou PH a odhadovanou PH. Čím je vyšší kovariance mezi PH a fenotypovou hodnotou (OPH), tím přesnější je odhad plemenné hodnoty na základě fenotypových hodnot. OPH je tím přesnější, čím vyšší je hodnota heritability vlastnosti.

Druhá mocnina korelace mezi PH a OPH se označuje jako spolehlivost odhadu PH - . Přesnost a spolehlivost má hodnoty v rozmezí od 0 do 1. Čím je vyšší spolehlivost, tím je vyšší OPH.

 

Plemenná hodnota pomocí frekvencí alel |

Aktualizováno: 07.10.2008

 

O nás | Mapa webu | Kontakt | ©2008 TGU