Dvoufaktorová hierarchická analýza variance pro odhad genetických parametrů
Design pokusu modelu zahrnujícího sledování skupin polosourozenců podle otců a vlastních sourozenců podle matek uvnitř otců (pro použití 2 faktorove hierarchické analýzy variance):
Odhad h2 u rodin vlastních sourozenců
Jedná se o komplikovanější odhad,neboť se vlastní sourozenci vyvíjí ve společném prostředí a je třeba uvažovat o efektu maternálního prostředí (VEC) a efektu dominance (VD).
Variance mezi rodinami úplných sourozenců = kovariance mezi úplných sourozenci = ½ VA + VEC + ¼ VD
Variance v rodinách úplných sourozenců = reziduální variance = VP – (½ VA + VEC + ¼ VD) = ½ VA + VE + ¾ VD
Odhadovaný koeficient heritability je často přeodhadnut, protože je obtížné oddělit genetické a ostatní efekty.
Model dvoufaktorové hierarchické analýzy variance:
yij = 
+ ai + bij + eij
- yij – užitkovost j-tého potomka po i-tém otce
- – obecný průměr populace
- ai – vliv i-tého otce
- bij – vliv j-té matky pod i-tým otcem
- eij – ostatní nahodilé vlivy
V případě souboru se skupinami podle polosourozenců (např. otcovský/sire model) vypočítáme genetické parametry z hodnot tabulky analýzy variance.
| Zdroj proměnlivosti | Součet čtverců odchylek (SS) |
Stupeň volnosti (f) | Průměrný čtverec (MS) | Složení MS |
|---|---|---|---|---|
| mezi skupinami podle otců | SSa | fa = k - 1 |  |
 |
| mezi skupinami podle matek uvnitř otců | SSb | fb = p - k |  |
 |
| mezi potomky uvnitř skupin podle matek | SSe | fe = n – p |  |
 |
| celková | SSc | fc = n – 1 |  |
- p - počet otců; m - počet matek, n - počet potomků
- průměrný počet potomků pro matku: n1 = n/m
- průměrný počet matek pro otce: m2 = m/p
- průměrný počet potomků pro otce: n3 = n/p
Výpočet odhadu komponent variance:
a) genetická variance podle matek: 
b) genetická variance podle otců: 
Když n1 = m2 pak 
c) variance prostředí: 
d) fenotypová variance: 
Výpočet odhadu koeficientů dědivosti:
a) podle otců: 
Střední chyba koeficientu dědivosti: 
b) podle matek: 
Střední chyba koeficientu dědivosti:
c) podle matek i otců: 
Střední chyba koeficientu dědivosti: 
|
Aktualizováno: 07.10.2008