Speciální případy náhodného páření
Multialelizmus - mnohonásobné alely
Genová a genotypová četnost rovnovážného stavu při alelické sérii (více než dvě alely v genovém páru v populaci) může být zapsána:
četnost alel: | p + q + ... + z = 1 |
četnost genotypů: | (p + q + ... + z)2 = 1 |
Asi nejznámějším genem s více alelami je gen pro krevní skupinu AB0 u lidí. Lokus I (isoaglutinin) má tři alely: IA, IB, I0 a tedy šest možných genotypů: IAIA, IBIB, I0I0, IAIB, IAI0, IBI0. Alely A a B jsou vůči sobě kodominantní a obě jsou dominantní vůči alele 0. Z toho vyplývá, že ve fenotypu lze určit jen čtyři kombinace: A (IAIA, IAI0), B (IBIB, IBI0), AB (IAIB) a 0 (I0I0).
p (IA) | q (IB) | r (I0) | |
---|---|---|---|
p (IA) |
p2 IAIA skupina A |
pq IAIB skupina AB |
pr IAI0 skupina A |
q (IB) |
pq IAIB skupina AB |
q2 IBIB skupina B |
qr IBI0 skupina B |
r (I0) |
pr IAI0 skupina A |
qr IBI0 skupina B |
r2 I0I0 skupina 0 |
Rovnice genetické rovnováhy pro AB0 lokus je: p2 (AA) + 2pq (AB) + q2 (BB) + 2pr (A0) + 2qr (B0) + r2 (00) = 1
Geny vázané na X chromozomu
Četnosti genotypů a alel za rovnovážného stavu u genů vázaných na pohlaví (na nehomologním úseku X chromozomu) jsou rozdílné podle pohlaví:
homogametní pohlaví (samice - female) |
heterogametní pohlaví (samci - male) |
||||
---|---|---|---|---|---|
genotypy | XAXA | XAXa | XaXa | XAY | XaY |
četnosti genotypů | p2 | 2pq | q2 | p | q |
gameta: A | pf = d + 1/2h | pm = d | |||
gameta: a |
qf = r + 1/2h | qm = r |
U heterogametního pohlaví dávají četnosti alel přímo četnosti genotypů, nevyskytují se heterozygoti (hemizygotnost)!
Očekávané relativní frekvence na X chromozom vázané vlastnosti:
frekvence samců | očekávané frekvence u samic |
---|---|
0,90 | 0,81 |
0,50 | 0,25 |
0,10 | 0,01 |
0,01 | 0,0001 |
0,001 | 0,000001 |
0,0001 | 0,00000001 |
r = q | r = q2 |
Jestliže frekvence alel na X chromozomů se liší u samců (m) a samic (f), pak populace není v rovnováze. Genetická rovnováha je dosažena, když: pf = pm a qf = qm. Ta není dosažitelná za jednu generaci. Protože samci dědí maternální X chromozom a frekvence alel u samic určuje frekvenci alel u samců v příští generaci: a . Dcery získají X chromozom maternální a paternální a frekvence alel je průměrem rodičovských frekvencí: a .
Frekvence gamet při vazbě, vazbová rovnováha
Náhodný výběr je to samé, jako náhodná kombinace gamet. Například pravděpodobnost potomstva s genotypem AABB je šance, že se gameta AB od otce a gameta AB od matky zkombinují. Za náhodného výběru: f(AABB) = f(AB|otce).f(AB|matky)
Pro heterozygoty může být více než jedna kombinace gamet, jež dá vzniknout stejnému genotypu: f(AaBB) = f(AB|otce).f(aB|matky).f(aB|otce).f(AB|matky).
Pokud pracujeme pouze s jedním lokusem, pak frekvence gamet je shodná s frekvencí alel a při podmínkách Hardy-Weinbergova zákona se tyto frekvence nemění během generací. Avšak pokud gamety, které uvažujeme, obsahují dva a více lokusů, pak rekombinace mohou způsobit, že se frekvence gamet v čase mění při podmínkách Hardy-Weinbergova zákona. Při vazbové rovnováze je frekvence u multilokusových gamet rovna součinu frekvencí alel. Např. u dvou, nebo tří lokusů:
- f(AB) = f(A).f(B) - pro dva lokusy
- f(ABC) = f(A).f(B).f(C) - pro tři lokusy
U vazbové rovnováhy, jsou-li alely na různých lokusech, pak jsou na sobě nezávislé, vědomost, že gameta obsahuje jednu alelu (řekněme A) nepřináší žádnou informaci o alele z druhého lokusu. Obecněji, lokus vykazuje vazbovou nerovnováhu, jež se také nazývá nerovnovážná gametická fáze, tak jako se to může přihodit mezi nevazebnými lokusy.
Nerovnováha DAB pro gamety AB je definována jako: DAB = f(AB) - f(A).f(B)
Předcházející rovnice ukazuje, že frekvence gamet je: f(AB) = f(A).f(B) + DAB
Je-li nerovnováha DAB > 0, obsahované gamety AB jsou více frekventované, než náhodně očekávané, zatímco je-li nerovnováha DAB < 0, tyto obsahované gamety jsou méně frekventované. Jestliže frekvence rekombinací mezi dvěma lokusy je c, pak nerovnováha po t generacích rekombinací je jednoduše: D(t) = D(0)(1 - c)t
Při neexistenci vazby (c se blíží 1⁄2) nerovnováha D velmi rychle mizí a gamety se rychle přibližují hodnotě vazbové rovnováhy. S úzkou vazbou může rovnováha setrvat po několik generací.
Aktualizováno: 28.02.2011