Struktura nukleových kyselin

tisk

genetická informace, dogma molekulární genetiky, informační makromolekuly, proteiny, aminokyseliny, nukleové kyseliny, nukleosidy, nukleotidy, fosfodiesterová vazba, párování bazí, primární a sekundární struktura NK, struktura RNA

Vlastnosti genetického materiálu

V předcházejících kapitolách bylo konstatováno, že geny jsou uloženy na chromozomech a kontrolují fenotypové vlastnosti a že chromozomy se specificky přenášejí gametami do dalších generací potomků. Geny tedy obsahují informace o formě a vlastnostech potomstva a tato informace se nazývá genetická informace. Až do roku 1944 nebylo zcela jasné, které chemické látky chromozomu tvoří podstatu genů. Zpočátku vedla teorie, že genetická informace je zapsána v sekvenci aminokyselin v proteinech chromozomu. Nakonec bylo dokázáno, že nukleové kyseliny (DNA) slouží jako "informační podklad" pro procesy dědičnosti. Byl postupně dokázán vztah mezi strukturou DNA a jejími funkcemi. Revoluční krok představoval rok 1953, kdy Watson a Crick předložili hypotetický návrh struktury DNA jako dvojité šroubovice.

Genetický materiál má několik vlastností:
  • reprodukce (replikace),
  • uchování informace (genofor),
  • projev informace (exprese),
  • variabilnost mutacemi.

Exprese genetické informace je komplexní proces a lze se jej představit jako informační tok (přesun informace pomocí informačních molekul z sekvence nukleotidů do sekvence aminokyselin) v buňce.

Souhrnně tyto procesy (směr "toku" genetické informace) představují tzv. centrální dogma molekulární genetiky:

DNA>RNA>protein

(Pozor však na dogmata!)

Informační makromolekuly

Mezi biologické makromolekuly řadíme látky s relativní molekulovou hmotností tisíc až několik set milionů. Jedná se o proteiny, nukleové kyseliny a polysacharidy. Informační charakter mají proteiny a nukleové kyseliny. Jejich informační funkce vyplývá z jejich struktury - polymerního charakteru (makromolekula složená z malých molekul, podjednotek označené jako monomery).   

Proteiny - bílkoviny

Jsou to makromolekuly složené z jednoho nebo více polypeptidových řetězců. Základními jednotkami jsou aminokyseliny. Aminokyseliny zařazované do peptidického řetězce během translace jsou standardní a je jich 21 typů.

Název Vzorec Název Vzorec
alanin 

(Ala, A) 

glutamin

(Gln, Q)

 

arginin

(Arg, R)

 

glutamová kys.

 (Glu, E)

 

asparagin

(Asn, N)

 

glycin

(Gly, G)

 

asparágová kys.

(Asp, D)

 

histidin

(His, H)

 

cystein

(Cys, C)

 

izoleucin

(Ile, I)

 

leucin

(Leu, L)

 

serin

(Ser, S)

 

lyzin

(Lys, K)

 

treonin

(Thr, T)

 

metionin 

(Met, M)

 

tryptofan

(Trp, W)

 

fenylalanin

(Phe, F)

 

tyrozin

(Tyr, Y)

 

prolin

(Pro, P)

 

valin

(Val, V)

 

  selenocystein

 (SeCys)

21. aminokyselina

Sekvence (pořadí) standardních aminokyselin v polypeptidovém řetězci tvoří primární strukturu proteinů, která tvoří základ specifičnosti každého proteinu. Primární struktura peptidu určuje tvorbu sekundární (a - helix či šroubovice a b - struktura či skládaný list).

Peptidová vazba:

Nukleové kyseliny

Jsou makromolekulární látky tvořené polynukleotidovými řetězci. Jedná se o polymer nukleotidů navzájem spojených fosfodiesterovými vazbami. Rozlišujeme:

  1. polyribonukleotidy (RNA řetězce) - monomerem jsou ribonukleotidy,
  2. polydeoxyribonukleotidy (DNA řetězce) - monomerem jsou deoxyribonukleotidy.

Báze

Cukry

Nukleosidy Nukleotidy
a) RNA
uridin

 UMP     uridylová kyselina (uridin-5´-monofosfát)

cytidin  CMP    cytidylová kyselina (citidin-5´-monofosfát)
adenozin

 AMP    adenylová kyselina (adenozin-5´-monofosfát)

guanozin

 GMP    guanylová kyselina (guanozin-5´-monofosfát)

b) DNA
2´deoxytymidin

 dTMP    deoxytymidilová kyselina (2´deoxytymidin-5´-monofosfát)

2´deoxycytidin  dCMP    deoxycytidylová kyselina (2´deoxycitidin-5´-monofosfát)
2´deoxyadenozin

 dAMP    deoxyadenylová kyselina (2´deoxyadenozin-5´-monofosfát)

2´deoxyguanozin

 dGMP    deoxyguanylová kyselina (2´deoxyguanozin-5´-monofosfát)

Příklad nukleosidu a nukleotidu s bazí adenin

Trifosfátová forma nukleosidů slouží jako prekurzor molekul během syntézy nukleové kyseliny. ATP a GTP jsou navíc důležité v buněčném metabolizmu, protože velké množství energie ukládají nebo vydávají koncovou fosfátovou skupinou. Hydrolýza ATP nebo GTP na ADP nebo GDP a anorganický fosfát (P) je doprovázena uvolněním velkého množství energie v buňce, potřebné k mnoha reakcím. Mimo jiné i v molekulárně genetických procesech.